Microbiologie I – Flashcards
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| Bdellovibrio |
answer
| Une predateur microbienne qui perce un trou dans la paroi cellulaire et s'insinue dans l'espace periplasmique. Interet pour l'usage comme probiotique |
question
| Vampirococcus |
answer
| Predateur microbienne qui s'attache en epibiote a la membrane externe de sa proie et secrete des enzymes de degradation qui liberent le cytoplasme du proie |
question
| Daptobacter |
answer
| Predateur microbienne qui penetre dans la cellule proie et se nourrit directement du contenu cytoplasmique |
question
| Effets benefiques de la predation? |
answer
| - peut conduire a l'augmentation des vitesses de recyclage des elements nutritifs - peut fournir un environnement protecteur, riche en nourriture pour une proie particuliere |
question
| Parasitisme |
answer
| Une relation entre deux organismes ou l'un des deux tire profit de l'autre, et ou l'hote est habituellement lese |
question
| Dans le parasitisme, pourquoi une relation equilibre hote-parasite est-elle importante? |
answer
| - Si l'equilibre favorise l'hote, le parasite perd son habitat et mourrit - Si l'equilibre favorise le parasite, il se peut que l'hote tombe malade et meure. |
question
| Donne un exemple microbien d'un parasite qui touche aux humains |
answer
| Rickettsia typhi, qui est vehiculee par les puces qui vivent sur les rats. Peut donner le typhus si les humains entrent en contact avec les rats |
question
| Decrire les lichens |
answer
| Une association entre des ascomycetes (champignon) et certains genres d'algues verts ou cyanobacteries. - partenaire fongique et le mycobiote - l'algue est le phycobiote (fait la photosynthese) =parasitisme du a la nature invasive que le champignon prend son NRG directement de l'algue |
question
| Reduction genomique |
answer
| une fois la parasite est etablie avec son hote, ly symbiote tendra a eliminer son information genomique non utilisee. Ex: bucherna aphidocola, mycobacterium leprae |
question
| Amensalisme |
answer
| Il s'agit d'un compose specifique qui a un effet negatif sur un autre organisme. Ex: antibiotiques |
question
| Donne un exemple d'amensalisme |
answer
| Fourmis qui tire profit d'une relation amensale entre un actinomycete pour controler les champignons parasites dans leur jardin fongique - le parasite: Escovopsis - l'espece voulu: Leucoprini - l'organisme 'antibiotique': Pseudonocardia |
question
| Fonction de la Nisine |
answer
| Bacteriocine amensalisme qui empeche le developpement de pathogenes dans les produits laitiers |
question
| Competition |
answer
| lorsque differents m.orgs d'une population ou d'une communaute cherchent a s'approprier une meme ressource, qu'il s'agisse d'occuper un endroit physique ou de consommer un aliment limitant particulier |
question
| Principe de l'exclusion competitive |
answer
| Si un des deux organismes en competition peut dominer le milieu, l'autre serai exclue. |
question
| Bacteriocines |
answer
| composes organiques specifiques qui provoquent des ruptures dans la paroi cellulaire ou la membrane cytoplasmique des m.orgs cibles |
question
| Pathogenicite |
answer
| La capacite de produire des modifications pathologiques, c-a-d une maladie. |
question
| Pathogene |
answer
| Un micro organisme qui provoque une maladie |
question
| Animaux axenique |
answer
| Sans micro organismes (sans germe/pas de flore). Utile pour la recherche sur les interactions des animaux et de leurs m. orgs. |
question
| Animaux gnotobiotique |
answer
| Animaux dont toute la microflore est connue OU un animal controle microbiologiquement |
question
| Quels avantages ont les bebes nourris au sein? |
answer
| La flore interne vient de ce qu'on mange. Le lait humain agit comme milieu selectif pour les bacreries non pathogenes. On voit 90% des bacs intestinales sont les bifidobacteries (benefices) |
question
| Decrire deux types de m.orgs commensaux sur la peau |
answer
| - Organismes residants qui se developpent normalement sur ou dans la peau - Transitoires: presents temporairement. (generalement incapables de se multiplier) |
question
| Keratinocytes |
answer
| epaisses cellules etroitement serrees qui constituent la couche externe de la peau |
question
| Cathelicidines |
answer
| Peptides antimicrobiens produits par les glandes sudiopares qui aident a la protection contre les agents infectieux en formant des pores dans les membranes cytoplasmiques bacteriennes |
question
| Quel antibiotique aidera a la traitement d'acne? |
answer
| tetracycline |
question
| Facteurs intrinseques |
answer
| facteurs lies a laliment lui-meme, comme le pH, l'humidite, disponibilite de l'eau |
question
| Facteurs extrinseques |
answer
| Facteurs lies a l'environnement ou l'aliment est stocke, comme temperature, humidite relative, les gaz (CO2, H2O) |
question
| Un aliment d'hydrates de carbone favorise la croissance de quel m.org? |
answer
| Champignons (sur le pains, confitures, etc) |
question
| Un aliment contenant de grandes quantites de proteines et/ou graisses (viande, beurre) favorise quelle croissance microbienne? |
answer
| Bacteries, qui les donne une odeur |
question
| Donner une maniere d'eliminer les m.orgs de la biere ou vin |
answer
| La filtration |
question
| Dogme central |
answer
| La voie qui mene de l'ADN a l'ARN et de l'ARN aux proteines |
question
| ARN polymerases catalyse quoi? |
answer
| La transcription |
question
| Decrit la traduction |
answer
| Un ARNm est decodee et regit la synthese d'un polypeptide. Les trois types d'ARN sont impliques dans la production des proteines. |
question
| Quels liaisons lient les chaines phosphate-sucre-base? |
answer
| Liaisons phosphodiester |
question
| Decrit l'helice d'ADN |
answer
| 10 paires de bases par tour d'helice, tournent dans le sens antihorlogique, grand sillon et petit sillon (asymetrique) |
question
| Histones |
answer
| Sont de petites proteines basiques, riches en lysine et arginine. Cing types: H1 H2A H2B H3 H4. 8 molecules forment un ellipsoide. Combinaison d'ADN et histones forment un nucleosome. |
question
| Ou commence la replication des chromosomes circulaires? |
answer
| L'origine |
question
| Decrit la replication d'un chromosome circulaire |
answer
| - Commence a l'origine - Deux fourches de replication se deplacent a partir de l'origine jusqu'a ce qu'elles aient copie tout le replicon |
question
| La synthese de l'ADN est catalysee par quels enzymes? |
answer
| ADN polymerases |
question
| Amorce |
answer
| ou la synthese d'ADN commence. Fournit un groupe 3'-hydroxyle libre |
question
| Enzymes noyaux |
answer
| responsable de la catalyse de la synthese de l'ADN et son autocorrection (Ex: ADN polymerase III) |
question
| Helicases |
answer
| Responsable de la separation des brins d'ADN |
question
| Les proteines SSB |
answer
| maintiennent les brins ADN eloignes l'un de l'autres quant ils ont ete separes |
question
| topoisomerases: role et un exemple |
answer
| soulagent la tension induite par le deroulement rapide de la double helice d'ADN Ex: ADN gyrase |
question
| Dans quel direction est-ce que les ADN polymerases synthetisent d'ADN? |
answer
| 5'-3' |
question
| Brin avance |
answer
| le brin complementaire d'ADN qui peut etre synthetise de facon continue a son extremite 3' (5'->3') |
question
| Brin retarde |
answer
| Brin qui ne peut etre synthetise de facon continue parce qu'il n'y a pas de 3'-OH libre. Elle est synthetise en fragments Okazaki. Ce brin requiert plusieurs amorces |
question
| Les deux brins d'ADN sont lies par quoi? |
answer
| ADN polymerase III (centromere) |
question
| Primase |
answer
| synthese un court brin d'ADN qui servira comme amorce |
question
| Locus oriC |
answer
| origine de la replication du chromosome |
question
| Catenane |
answer
| Chromosome circulaire filles entrelaces apres la replication. Achevement par les topoisomerases |
question
| Telomerase |
answer
| Assure que la longueur du chromosome d'ADN est maintenue pour les chromosomes lineaires. Deux composants: une proteine qui peut synthetiser de l'ADN en utilisant une matrice d'ARN (transcriptase inverse telomerase) et une matrice ARN interne |
question
| Gene |
answer
| Une sequence lineaire de nucleotides avec un point de depart et un point de terminaison precis |
question
| Extrons |
answer
| sequence des genes eucaryotes qui peuvent etre codees. Sont interrompus par des sequences non-codants (introns) |
question
| Introns |
answer
| sequence de genes non-codants des eucaryotes |
question
| ARNm |
answer
| ARN produit par un gene qui code pour une proteine |
question
| Promoteur |
answer
| situe au debut du gene. Un site de reconnaissance et de liaison pour l'ARN polymerase. N'est ni transcrit, ni traduit. |
question
| ARN polymerase |
answer
| L'enzyme qui synthetise l'ARN |
question
| Codon stop |
answer
| signale la fin de la proteine et arrete la traduction par le ribosome. Au cours de la transcription sa deloge l'ARN polymerase de l'ADN matrice |
question
| Trois processus de la transcription |
answer
| Initiation, elongation, terminaison |
question
| Qu'est-ce que commence l'initiation de la transcription? |
answer
| Liaison de l'ARN polymerase au promoteur du gene |
question
| Que signifie TATAAT? |
answer
| Region sur le promoteur bacterien; point du depart de transcription |
question
| Comment differe-t-elle la transcription chez les eucaryote de celle des procaryotes? |
answer
| - 3 ARN polymerases majeurs (1 pour bacs) - Ce ARN polymerase II a besoin de facteurs de transcription supplementaires pour reconnaitre les promoteurs - Promoteurs eucaryotes ont la boite TATA - ARNm eucaryotes subit des modifications post-transcriptionnelles - on ne trouve pas vraiment de genes interrompus (introns/extrons) chez les procaryotes |
question
| ARN polymerase II |
answer
| synthese de l'ARNm pendant la transcription |
question
| ARN polymerases I et III |
answer
| synthetisent respectivemetn l'ARNr et l'ARNt |
question
| Epissage de l'ARN |
answer
| les introns sont excises des transcrits initiaux d'ARN (pre-ARNm) - une sequence GU a l'extremite 5' de l'intron et une sequence AG a son extremite 3' |
question
| Decrit la transcription chez les archees |
answer
| - Une seule ARN polymerase - Cette polymerase par contre est plus semblable au ARN polymerase II des eucaryotes - presence de boite TATA sur le promoteur comme les eucaryotes - Certains genes archeens contiennent des introns, donc besoin de traitement post-transcriptionnel |
question
| Que signifie les codons UGA, UAG et UAA |
answer
| ce sont des codons stop ou codons non-sens |
question
| Traduction |
answer
| Le decodage de l'ARNm pour former un polypeptide (proteine). Son synthese commence par le bout N-terminal. |
question
| Polyribosome ou Polysome |
answer
| Une complexe d'ARN et plusieurs ribosomes. Augmente la vitesse de la synthese d'un polypeptide (efficacite) |
question
| Pourquoi les archees et les bacs peuvent encore augmenter l'efficacite de l'expression d'un gene en couplant transcription et traduction? |
answer
| Ils n'ont pas de noyau, alors des que l'ARN polymerase synthetise un ARNm, les ribosomes peuvent deja attacher au ARNm et le traduire. |
question
| Ou est l'acide amine sur l'ARNt? |
answer
| Il se lie a l'acide adenylique terminal a l'extremite 3' (sequence -C-C-A) |
question
| aminoacyl-ARNt synthetases |
answer
| catalyse une reaction durant laquelle les acides amines sont actives pour la synthese des proteines. Il en existe 20, un pour chaque a.a.. Certains d'entre eux font l'autocorrection comme les ADN polymerases |
question
| Decrit les ribosomes des 3 domaines |
answer
| - Procaryotes 70S - Eucaryotes 80S |
question
| Edward Jenner |
answer
| Premier vaccin contre la variole |
question
| Charles Chamberland |
answer
| collaborer avec Louis Pasteur et inventer le premier autoclave et rendit possible la decouvert des virus. Filtre en porcelaine |
question
| Ivanowski |
answer
| Publier des travaux avec des plantes infectees, meme avoir ete filtres pour enlever les bacteries. Preuve des virus |
question
| Walter Reed |
answer
| Fievre jaune |
question
| Virion |
answer
| Une particule virale complete formee d'une ou plusieurs molecules d'ARN ou d'ADN enfermees dans une coque proteique (capside) |
question
| 3 differences entre les virus et les cellules vivantes |
answer
| 1- organisation simple et acellulaire 2- presence de soit ADN ou ARN mais pas les deux ensembles 3- incapacite de se reproduire sans un hote |
question
| Quel microscope permet l'observation des virus? |
answer
| Microscopes electroniques, soit a balayage ou a transmission |
question
| Nucleocapside |
answer
| Composee d'un acide nucleique (soit ADN ou ARN) et une coque proteique appelee capside |
question
| Trois types de symetrie de capside chez les virus |
answer
| - Helicoidale: arrangement en spirale - icosaedrique: prefere par la nature. - complexe |
question
| Protomeres |
answer
| Forme soit des hexons out pentons dans une capside icosaedrique. Ce sont de nombreuses copies d'une ou quelques sous-unites proteiques |
question
| Quel virus possede une capside icosaedrique contenant uniquement des pentameres? |
answer
| Virus simien 40 (SV 40) |
question
| Enveloppe virale (structure et fonction) |
answer
| Provient generalement des membranes des cellules hotes. Peuvent avoir des spicules provenant des virus memes. Ce sert a identifier les virus. On trouve a la facec interne une proteine non glycosylee stabilisatrice (proteine M) |
question
| Neuraminidase |
answer
| Projections (spicules) sur l'enveloppe des virus qui participe a la liberation des virions matures |
question
| Hemagglutines |
answer
| Projections (spicules) sur l'enveloppe des virus qui peuvent attacher aux membranes des globules rouges et causer l'hemagglutination |
question
| Lister les 4 types possibles d'acide nucleiques chez les virus |
answer
| ARN simple brin, ARN double brin, ADN simple brin, ADN double brin |
question
| Quel sorte de genome possede les virus des vegetaux la plupart du temps? |
answer
| ARN simple brin |
question
| Quel sorte de genome possede les bacteriophage, en general? |
answer
| ADN double brin |
question
| Quelle est la particularite du genome du virus phage lambda? |
answer
| ADN lineaire dans la capside mais circulaire en entrant dans la cellule hote |
question
| Chaine positive ou chaine plus (et un exemple) |
answer
| Quand la sequence des bases de certains ARNsb genomiques est identique a celle de l'ARNm viral Ex: poliomyelite (polio) |
question
| Chaine negative ou chaine moins (et un exemple) |
answer
| Quand l'ARNsb genomique a une sequence complementaire de celle de l'ARNm viral Ex: rage |
question
| Donnez les 5 etapes de la multiplication des virus |
answer
| 1- fixation du virus sur la cellule hote 2- entree de l'acide nucleique (genome) du virus 3- synthese des proteines et acides nucleiques du virus 4- auto-assemblage des virions 5- liberation des nouveaux virus |
question
| Explique brievement la classification des virus |
answer
| Par leurs acides nucleiques, presence ou l'absence d'enveloppe, symetrie de la capside |
question
| Classification phylogenetique |
answer
| Comparer des organismes (classifier) sur la base de relations evolutives |
question
| Classification phenetique |
answer
| Groupe les organismes par la similitide de leurs caracteres physiques (ce qu'on peut voir) |
question
| Classification genotypique |
answer
| Comparer la similarite genetique entre organismes |
question
| L'hypothese endosymbiotique |
answer
| Les mitochondries et les chlorophlastes proviennent des bacteries |
question
| Ribozymes |
answer
| molecules d'ARN possedent une activite catalytique |
question
| Pourquoi pense-t-on que l'ARN s'est apparu en premier? |
answer
| Il est capable d'effectuer du travail et de stocker l'information genetique. |
question
| L'arbre phylogenetique de Carl Woese est base sur quoi? |
answer
| les sequences des ARN de la petite sous-unite ribosomique (ARNr PSU) |
question
| Microevolution (anagenese) |
answer
| De petits changements genetiques aleatoires qui se produisent pendant des generations pour mener lentement soit a la speciation, soit a l'extinction |
question
| Theorie des equilibres ponctues |
answer
| Le rythme de l'evolution est interrompu periodiquement par des explosions rapides de speciation |
question
| 3 parties de la taxinomie |
answer
| Classification: repartir les organismes dans des groupes appeles taxons Nomenclature: donne des noms aux groupes taxinomiques Identification: cote pratique de la taxinomie; determiner a quel taxon appartient l'organisme |
question
| Hypothese de l'hydrogene |
answer
| avec l'hypothese endosymbiotique. C'est que l'endosymbiote etait une bacterie anaerobie avec H2 et CO2 comme produits finals de fermentation. S'il a developpe la capacite d'effectuer la respiration aerobie = mitochondrie. S'il n'a pas acquis cette faculte - hydrogenosome (trouve chez certains protistes qui produisent l'ATP par fermentation) |
question
| Donner les rangs taxinomiques en ordre decroissante (Tableau 19.3) |
answer
| Domaine, Phylum, Classe, Ordre, Famille, Genre, Espece |
question
| Taxinomie font usage de quels caracteristiques? |
answer
| - Morphologiques: (taille, forme, etc) - Physiologiques: sources d'NRG, etc - Ecologiques: environnement - Genetiques: sequence de genes |
question
| Quel est le methode le plus utile pour determiner le taxon d'une organisme? |
answer
| sequencage genomique: IL peut nous donner sa famille, genre, espece, sous-espece et souche |
question
| Pasteurisation |
answer
| Chauffage des aliments a une temperature qui tue les micro organismes pathogenes |
question
| Radiations UV |
answer
| Sterilisation a la surface des aliments et l'equipement de laboratoire. Ne penetrent pas dans la nourriture. |
question
| Utilite de la refrigeration |
answer
| Retarde le developpement microbien |
question
| [image] |
answer
question
| Cyanophycine |
answer
| Compose d'une quantite egale d'Arg et Asp. Reserve d'azote pour les bacteries. |
question
| Decrit brievement la structure des ribosomes 70S |
answer
| Formes de deux sous-unites, une 50S et une 30S. Chez les procaryotes (bacs et archees). |
question
| Plasmides |
answer
| Molecules d'ADN circulaire extrachromatique |
question
| Listez quelques plasmides importantes |
answer
| Conjugatifs : contenant facteur F (fertilite) Plasmides R: resistance aux antibiotiques |
question
| Decrivez la paroi d'une bacterie gram negative |
answer
| Membrane cytoplasmique, espace periplasmique avec peptidoglycane (mince couche), membrance externe. |
question
| Decrivez la paroi d'une cellule gram-positive |
answer
| Membrane cytoplasmique, paroi cellulaire fait de peptidoglycanes (couche epaisse) |
question
| Explique l'importance d'acide D-glutamique, D--alamine et l'acide meso-diaminopimelique |
answer
| Empechent une degradation par la plupart des peptidases qui ne reconnaissent que les isomeres L des acides amines. |
question
| Beaucoup des paroi bacteriennes remplace l'acide meso-diaminopimelique avec quel autre acide diamine? |
answer
| L-lysine |
question
| Les acides teichoiques se trouve chez les bacs gram + ou gram -? |
answer
| Gram + |
question
| Comment la membrane externe des gram - se lie a la cellule? |
answer
| - Lipoproteine de Braun - sites d'adhesion |
question
| Dans la coloration de Gram, le colorant cristal violet agit avec quelle partie du paroi? [?] |
answer
| Acides lipotechoiques |
