Microbiologie I – Flashcards
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Parasitisme |
answer
Une relation entre deux organismes ou l'un des deux tire profit de l'autre, et ou l'hote est habituellement lese |
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question
Dans le parasitisme, pourquoi une relation equilibre hote-parasite est-elle importante? |
answer
- Si l'equilibre favorise l'hote, le parasite perd son habitat et mourrit - Si l'equilibre favorise le parasite, il se peut que l'hote tombe malade et meure. |
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question
Donne un exemple microbien d'un parasite qui touche aux humains |
answer
Rickettsia typhi, qui est vehiculee par les puces qui vivent sur les rats. Peut donner le typhus si les humains entrent en contact avec les rats |
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question
Decrire les lichens |
answer
Une association entre des ascomycetes (champignon) et certains genres d'algues verts ou cyanobacteries. - partenaire fongique et le mycobiote - l'algue est le phycobiote (fait la photosynthese) =parasitisme du a la nature invasive que le champignon prend son NRG directement de l'algue |
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question
Reduction genomique |
answer
une fois la parasite est etablie avec son hote, ly symbiote tendra a eliminer son information genomique non utilisee. Ex: bucherna aphidocola, mycobacterium leprae |
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question
Amensalisme |
answer
Il s'agit d'un compose specifique qui a un effet negatif sur un autre organisme. Ex: antibiotiques |
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question
Donne un exemple d'amensalisme |
answer
Fourmis qui tire profit d'une relation amensale entre un actinomycete pour controler les champignons parasites dans leur jardin fongique - le parasite: Escovopsis - l'espece voulu: Leucoprini - l'organisme 'antibiotique': Pseudonocardia |
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question
Fonction de la Nisine |
answer
Bacteriocine amensalisme qui empeche le developpement de pathogenes dans les produits laitiers |
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question
Competition |
answer
lorsque differents m.orgs d'une population ou d'une communaute cherchent a s'approprier une meme ressource, qu'il s'agisse d'occuper un endroit physique ou de consommer un aliment limitant particulier |
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question
Principe de l'exclusion competitive |
answer
Si un des deux organismes en competition peut dominer le milieu, l'autre serai exclue. |
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question
Bacteriocines |
answer
composes organiques specifiques qui provoquent des ruptures dans la paroi cellulaire ou la membrane cytoplasmique des m.orgs cibles |
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question
Pathogenicite |
answer
La capacite de produire des modifications pathologiques, c-a-d une maladie. |
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question
Pathogene |
answer
Un micro organisme qui provoque une maladie |
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question
Animaux axenique |
answer
Sans micro organismes (sans germe/pas de flore). Utile pour la recherche sur les interactions des animaux et de leurs m. orgs. |
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question
Animaux gnotobiotique |
answer
Animaux dont toute la microflore est connue OU un animal controle microbiologiquement |
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question
Quels avantages ont les bebes nourris au sein? |
answer
La flore interne vient de ce qu'on mange. Le lait humain agit comme milieu selectif pour les bacreries non pathogenes. On voit 90% des bacs intestinales sont les bifidobacteries (benefices) |
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question
Decrire deux types de m.orgs commensaux sur la peau |
answer
- Organismes residants qui se developpent normalement sur ou dans la peau - Transitoires: presents temporairement. (generalement incapables de se multiplier) |
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question
Keratinocytes |
answer
epaisses cellules etroitement serrees qui constituent la couche externe de la peau |
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question
Cathelicidines |
answer
Peptides antimicrobiens produits par les glandes sudiopares qui aident a la protection contre les agents infectieux en formant des pores dans les membranes cytoplasmiques bacteriennes |
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question
Quel antibiotique aidera a la traitement d'acne? |
answer
tetracycline |
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question
Facteurs intrinseques |
answer
facteurs lies a laliment lui-meme, comme le pH, l'humidite, disponibilite de l'eau |
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question
Facteurs extrinseques |
answer
Facteurs lies a l'environnement ou l'aliment est stocke, comme temperature, humidite relative, les gaz (CO2, H2O) |
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question
Un aliment d'hydrates de carbone favorise la croissance de quel m.org? |
answer
Champignons (sur le pains, confitures, etc) |
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question
Un aliment contenant de grandes quantites de proteines et/ou graisses (viande, beurre) favorise quelle croissance microbienne? |
answer
Bacteries, qui les donne une odeur |
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question
Donner une maniere d'eliminer les m.orgs de la biere ou vin |
answer
La filtration |
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question
Dogme central |
answer
La voie qui mene de l'ADN a l'ARN et de l'ARN aux proteines |
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question
ARN polymerases catalyse quoi? |
answer
La transcription |
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question
Decrit la traduction |
answer
Un ARNm est decodee et regit la synthese d'un polypeptide. Les trois types d'ARN sont impliques dans la production des proteines. |
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question
Quels liaisons lient les chaines phosphate-sucre-base? |
answer
Liaisons phosphodiester |
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question
Decrit l'helice d'ADN |
answer
10 paires de bases par tour d'helice, tournent dans le sens antihorlogique, grand sillon et petit sillon (asymetrique) |
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question
Histones |
answer
Sont de petites proteines basiques, riches en lysine et arginine. Cing types: H1 H2A H2B H3 H4. 8 molecules forment un ellipsoide. Combinaison d'ADN et histones forment un nucleosome. |
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question
Ou commence la replication des chromosomes circulaires? |
answer
L'origine |
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question
Decrit la replication d'un chromosome circulaire |
answer
- Commence a l'origine - Deux fourches de replication se deplacent a partir de l'origine jusqu'a ce qu'elles aient copie tout le replicon |
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question
La synthese de l'ADN est catalysee par quels enzymes? |
answer
ADN polymerases |
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question
Amorce |
answer
ou la synthese d'ADN commence. Fournit un groupe 3'-hydroxyle libre |
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question
Enzymes noyaux |
answer
responsable de la catalyse de la synthese de l'ADN et son autocorrection (Ex: ADN polymerase III) |
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question
Helicases |
answer
Responsable de la separation des brins d'ADN |
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question
Les proteines SSB |
answer
maintiennent les brins ADN eloignes l'un de l'autres quant ils ont ete separes |
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question
topoisomerases: role et un exemple |
answer
soulagent la tension induite par le deroulement rapide de la double helice d'ADN Ex: ADN gyrase |
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question
Dans quel direction est-ce que les ADN polymerases synthetisent d'ADN? |
answer
5'-3' |
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question
Brin avance |
answer
le brin complementaire d'ADN qui peut etre synthetise de facon continue a son extremite 3' (5'->3') |
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question
Brin retarde |
answer
Brin qui ne peut etre synthetise de facon continue parce qu'il n'y a pas de 3'-OH libre. Elle est synthetise en fragments Okazaki. Ce brin requiert plusieurs amorces |
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question
Les deux brins d'ADN sont lies par quoi? |
answer
ADN polymerase III (centromere) |
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question
Primase |
answer
synthese un court brin d'ADN qui servira comme amorce |
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question
Locus oriC |
answer
origine de la replication du chromosome |
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question
Catenane |
answer
Chromosome circulaire filles entrelaces apres la replication. Achevement par les topoisomerases |
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question
Telomerase |
answer
Assure que la longueur du chromosome d'ADN est maintenue pour les chromosomes lineaires. Deux composants: une proteine qui peut synthetiser de l'ADN en utilisant une matrice d'ARN (transcriptase inverse telomerase) et une matrice ARN interne |
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question
Gene |
answer
Une sequence lineaire de nucleotides avec un point de depart et un point de terminaison precis |
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question
Extrons |
answer
sequence des genes eucaryotes qui peuvent etre codees. Sont interrompus par des sequences non-codants (introns) |
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question
Introns |
answer
sequence de genes non-codants des eucaryotes |
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question
ARNm |
answer
ARN produit par un gene qui code pour une proteine |
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question
Promoteur |
answer
situe au debut du gene. Un site de reconnaissance et de liaison pour l'ARN polymerase. N'est ni transcrit, ni traduit. |
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question
ARN polymerase |
answer
L'enzyme qui synthetise l'ARN |
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question
Codon stop |
answer
signale la fin de la proteine et arrete la traduction par le ribosome. Au cours de la transcription sa deloge l'ARN polymerase de l'ADN matrice |
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question
Trois processus de la transcription |
answer
Initiation, elongation, terminaison |
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question
Qu'est-ce que commence l'initiation de la transcription? |
answer
Liaison de l'ARN polymerase au promoteur du gene |
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question
Que signifie TATAAT? |
answer
Region sur le promoteur bacterien; point du depart de transcription |
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question
Comment differe-t-elle la transcription chez les eucaryote de celle des procaryotes? |
answer
- 3 ARN polymerases majeurs (1 pour bacs) - Ce ARN polymerase II a besoin de facteurs de transcription supplementaires pour reconnaitre les promoteurs - Promoteurs eucaryotes ont la boite TATA - ARNm eucaryotes subit des modifications post-transcriptionnelles - on ne trouve pas vraiment de genes interrompus (introns/extrons) chez les procaryotes |
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question
ARN polymerase II |
answer
synthese de l'ARNm pendant la transcription |
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question
ARN polymerases I et III |
answer
synthetisent respectivemetn l'ARNr et l'ARNt |
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question
Epissage de l'ARN |
answer
les introns sont excises des transcrits initiaux d'ARN (pre-ARNm) - une sequence GU a l'extremite 5' de l'intron et une sequence AG a son extremite 3' |
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question
Decrit la transcription chez les archees |
answer
- Une seule ARN polymerase - Cette polymerase par contre est plus semblable au ARN polymerase II des eucaryotes - presence de boite TATA sur le promoteur comme les eucaryotes - Certains genes archeens contiennent des introns, donc besoin de traitement post-transcriptionnel |
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question
Que signifie les codons UGA, UAG et UAA |
answer
ce sont des codons stop ou codons non-sens |
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question
Traduction |
answer
Le decodage de l'ARNm pour former un polypeptide (proteine). Son synthese commence par le bout N-terminal. |
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question
Polyribosome ou Polysome |
answer
Une complexe d'ARN et plusieurs ribosomes. Augmente la vitesse de la synthese d'un polypeptide (efficacite) |
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question
Pourquoi les archees et les bacs peuvent encore augmenter l'efficacite de l'expression d'un gene en couplant transcription et traduction? |
answer
Ils n'ont pas de noyau, alors des que l'ARN polymerase synthetise un ARNm, les ribosomes peuvent deja attacher au ARNm et le traduire. |
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question
Ou est l'acide amine sur l'ARNt? |
answer
Il se lie a l'acide adenylique terminal a l'extremite 3' (sequence -C-C-A) |
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question
aminoacyl-ARNt synthetases |
answer
catalyse une reaction durant laquelle les acides amines sont actives pour la synthese des proteines. Il en existe 20, un pour chaque a.a.. Certains d'entre eux font l'autocorrection comme les ADN polymerases |
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question
Decrit les ribosomes des 3 domaines |
answer
- Procaryotes 70S - Eucaryotes 80S |
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question
Edward Jenner |
answer
Premier vaccin contre la variole |
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question
Charles Chamberland |
answer
collaborer avec Louis Pasteur et inventer le premier autoclave et rendit possible la decouvert des virus. Filtre en porcelaine |
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question
Ivanowski |
answer
Publier des travaux avec des plantes infectees, meme avoir ete filtres pour enlever les bacteries. Preuve des virus |
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question
Walter Reed |
answer
Fievre jaune |
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question
Virion |
answer
Une particule virale complete formee d'une ou plusieurs molecules d'ARN ou d'ADN enfermees dans une coque proteique (capside) |
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question
3 differences entre les virus et les cellules vivantes |
answer
1- organisation simple et acellulaire 2- presence de soit ADN ou ARN mais pas les deux ensembles 3- incapacite de se reproduire sans un hote |
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question
Quel microscope permet l'observation des virus? |
answer
Microscopes electroniques, soit a balayage ou a transmission |
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question
Nucleocapside |
answer
Composee d'un acide nucleique (soit ADN ou ARN) et une coque proteique appelee capside |
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question
Trois types de symetrie de capside chez les virus |
answer
- Helicoidale: arrangement en spirale - icosaedrique: prefere par la nature. - complexe |
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question
Protomeres |
answer
Forme soit des hexons out pentons dans une capside icosaedrique. Ce sont de nombreuses copies d'une ou quelques sous-unites proteiques |
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question
Quel virus possede une capside icosaedrique contenant uniquement des pentameres? |
answer
Virus simien 40 (SV 40) |
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question
Enveloppe virale (structure et fonction) |
answer
Provient generalement des membranes des cellules hotes. Peuvent avoir des spicules provenant des virus memes. Ce sert a identifier les virus. On trouve a la facec interne une proteine non glycosylee stabilisatrice (proteine M) |
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question
Neuraminidase |
answer
Projections (spicules) sur l'enveloppe des virus qui participe a la liberation des virions matures |
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question
Hemagglutines |
answer
Projections (spicules) sur l'enveloppe des virus qui peuvent attacher aux membranes des globules rouges et causer l'hemagglutination |
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question
Lister les 4 types possibles d'acide nucleiques chez les virus |
answer
ARN simple brin, ARN double brin, ADN simple brin, ADN double brin |
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question
Quel sorte de genome possede les virus des vegetaux la plupart du temps? |
answer
ARN simple brin |
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question
Quel sorte de genome possede les bacteriophage, en general? |
answer
ADN double brin |
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question
Quelle est la particularite du genome du virus phage lambda? |
answer
ADN lineaire dans la capside mais circulaire en entrant dans la cellule hote |
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question
Chaine positive ou chaine plus (et un exemple) |
answer
Quand la sequence des bases de certains ARNsb genomiques est identique a celle de l'ARNm viral Ex: poliomyelite (polio) |
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question
Chaine negative ou chaine moins (et un exemple) |
answer
Quand l'ARNsb genomique a une sequence complementaire de celle de l'ARNm viral Ex: rage |
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question
Donnez les 5 etapes de la multiplication des virus |
answer
1- fixation du virus sur la cellule hote 2- entree de l'acide nucleique (genome) du virus 3- synthese des proteines et acides nucleiques du virus 4- auto-assemblage des virions 5- liberation des nouveaux virus |
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question
Explique brievement la classification des virus |
answer
Par leurs acides nucleiques, presence ou l'absence d'enveloppe, symetrie de la capside |
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question
Classification phylogenetique |
answer
Comparer des organismes (classifier) sur la base de relations evolutives |
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question
Classification phenetique |
answer
Groupe les organismes par la similitide de leurs caracteres physiques (ce qu'on peut voir) |
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question
Classification genotypique |
answer
Comparer la similarite genetique entre organismes |
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question
L'hypothese endosymbiotique |
answer
Les mitochondries et les chlorophlastes proviennent des bacteries |
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question
Ribozymes |
answer
molecules d'ARN possedent une activite catalytique |
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question
Pourquoi pense-t-on que l'ARN s'est apparu en premier? |
answer
Il est capable d'effectuer du travail et de stocker l'information genetique. |
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question
L'arbre phylogenetique de Carl Woese est base sur quoi? |
answer
les sequences des ARN de la petite sous-unite ribosomique (ARNr PSU) |
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question
Microevolution (anagenese) |
answer
De petits changements genetiques aleatoires qui se produisent pendant des generations pour mener lentement soit a la speciation, soit a l'extinction |
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question
Theorie des equilibres ponctues |
answer
Le rythme de l'evolution est interrompu periodiquement par des explosions rapides de speciation |
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question
3 parties de la taxinomie |
answer
Classification: repartir les organismes dans des groupes appeles taxons Nomenclature: donne des noms aux groupes taxinomiques Identification: cote pratique de la taxinomie; determiner a quel taxon appartient l'organisme |
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question
Hypothese de l'hydrogene |
answer
avec l'hypothese endosymbiotique. C'est que l'endosymbiote etait une bacterie anaerobie avec H2 et CO2 comme produits finals de fermentation. S'il a developpe la capacite d'effectuer la respiration aerobie = mitochondrie. S'il n'a pas acquis cette faculte - hydrogenosome (trouve chez certains protistes qui produisent l'ATP par fermentation) |
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question
Donner les rangs taxinomiques en ordre decroissante (Tableau 19.3) |
answer
Domaine, Phylum, Classe, Ordre, Famille, Genre, Espece |
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question
Taxinomie font usage de quels caracteristiques? |
answer
- Morphologiques: (taille, forme, etc) - Physiologiques: sources d'NRG, etc - Ecologiques: environnement - Genetiques: sequence de genes |
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question
Quel est le methode le plus utile pour determiner le taxon d'une organisme? |
answer
sequencage genomique: IL peut nous donner sa famille, genre, espece, sous-espece et souche |
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question
Pasteurisation |
answer
Chauffage des aliments a une temperature qui tue les micro organismes pathogenes |
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question
Radiations UV |
answer
Sterilisation a la surface des aliments et l'equipement de laboratoire. Ne penetrent pas dans la nourriture. |
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question
Utilite de la refrigeration |
answer
Retarde le developpement microbien |
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question
[image] |
answer
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question
Cyanophycine |
answer
Compose d'une quantite egale d'Arg et Asp. Reserve d'azote pour les bacteries. |
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question
Decrit brievement la structure des ribosomes 70S |
answer
Formes de deux sous-unites, une 50S et une 30S. Chez les procaryotes (bacs et archees). |
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question
Plasmides |
answer
Molecules d'ADN circulaire extrachromatique |
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question
Listez quelques plasmides importantes |
answer
Conjugatifs : contenant facteur F (fertilite) Plasmides R: resistance aux antibiotiques |
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question
Decrivez la paroi d'une bacterie gram negative |
answer
Membrane cytoplasmique, espace periplasmique avec peptidoglycane (mince couche), membrance externe. |
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question
Decrivez la paroi d'une cellule gram-positive |
answer
Membrane cytoplasmique, paroi cellulaire fait de peptidoglycanes (couche epaisse) |
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question
Explique l'importance d'acide D-glutamique, D--alamine et l'acide meso-diaminopimelique |
answer
Empechent une degradation par la plupart des peptidases qui ne reconnaissent que les isomeres L des acides amines. |
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question
Beaucoup des paroi bacteriennes remplace l'acide meso-diaminopimelique avec quel autre acide diamine? |
answer
L-lysine |
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question
Les acides teichoiques se trouve chez les bacs gram + ou gram -? |
answer
Gram + |
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question
Comment la membrane externe des gram - se lie a la cellule? |
answer
- Lipoproteine de Braun - sites d'adhesion |
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question
Dans la coloration de Gram, le colorant cristal violet agit avec quelle partie du paroi? [?] |
answer
Acides lipotechoiques |
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